Domingueira nº 18 - Junho 2025

A vigilância genômica pode prever a próxima pandemia?

Por Carmino de Souza

A Covid pegou o mundo de surpresa — mas, provavelmente não seremos enganados novamente. Isso graças às tecnologias aceleradas de sequenciamento do genoma, às capacidades laboratoriais expandidas e à infraestrutura interativa em nível global. Esses fatores estão convergindo para permitir tanto a identificação de novas doenças infecciosas quanto a resistência microbiana. O conceito de uma resposta global coordenada a doenças infecciosas remonta à 1800, originalmente baseada no reconhecimento da relação das doenças dos humanos com as de outras espécies animais. Saúde é “uma abordagem integrada e unificadora que reconhece que a saúde dos humanos, dos animais domésticos e selvagens, das plantas e do meio ambiente em geral (incluindo ecossistemas) estão intimamente ligados e são interdependentes”.

A capacidade atual de sequenciar e comparar rapidamente genomas virais e bacterianos completos leva o conceito de One Health a um novo patamar, impulsionando o monitoramento em tempo real do surgimento de novos patógenos, seus padrões de disseminação, taxa de infecção e, talvez o mais importante, como eles evoluem. Uma abordagem de One Health requer o compartilhamento de bancos de dados de vigilância e sequenciamento entre todas as nações e a construção da infraestrutura e do conhecimento para isso, a fim de prevenir, detectar, preparar, responder e gerenciar pandemias em desenvolvimento.

A Covid claramente nos pegou desprevenidos. Teríamos ficado mais preparados em um mundo livre de uma lista de doenças infecciosas antes mortais, graças em grande parte às vacinas e outras medidas de saúde pública? Os anos da Covid estão começando a parecer um borrão, um lapso de tempo que talvez seja melhor esquecer. Em retrospecto, tudo se desenrolou com uma velocidade impressionante.

Poucos dias depois do Ano Novo de 2020, ouvimos a BBC News relatar os primeiros casos na China. Duas semanas depois, Nancy Messonnier, diretora do Centro Nacional de Imunização e Doenças Respiratórias do CDC, em uma coletiva de imprensa disse: “Em 30 de dezembro, a China relatou um surto de doença respiratória na cidade de Wuhan, um importante centro de transporte a cerca de 1100 quilômetros ao sul de Pequim, com uma população de mais de 11 milhões de pessoas.”

Há muito tempo há uma crença de que o SARS-CoV-2, ou um predecessor viral imediato, tenha surgido anos antes de 2019 – pelo menos já em 2013. A evidência de uma origem anterior reside nas sequências do genoma viral, especificamente o coronavírus de morcego RaTG13. “Um salto do vírus RaTG13 encontrado no esterco de morcegos da mina abandonada em 2013 para o surgimento do SARS-CoV-2 em 2019 é como ler o primeiro e o último capítulos de um romance: não há enredo suficiente para reconstruir uma história. Mas, à medida que mais capítulos são revelados, parece que o SARS-CoV-2 surgiu de um conjunto de vírus — e continua a evoluir.”

Sempre que e onde quer que o vírus tenha surgido, o CDC alertou oficialmente os médicos sobre a nova doença respiratória mortal em 8 de janeiro de 2020. O primeiro caso nos EUA chamou a atenção de um médico em 21 de janeiro. Um centro de compensação online na OMS para sequências genômicas de vírus da gripe foi rapidamente adaptado para lidar com o novo coronavírus: GISAID, para Iniciativa Global sobre Compartilhamento de Todos os Dados da Gripe (GISAID.org).

“O compartilhamento de dados de sequência do SARS-CoV-2 por meio do banco de dados GISAID permitiu que países ao redor do mundo entendessem quais variantes estavam surgindo e circulando nacional e internacionalmente. Isso permitiu respostas antecipadas para mitigar a transmissão de novas variantes através das fronteiras e para a alteração dos procedimentos de teste e sequenciamento para detectar novas variantes. E assim as variantes alfa, delta e ômicron surgiram”, escrevem os autores do artigo da Frontiers in Science. Outros bancos de dados genômicos foram reformulados para os enormes conjuntos de dados gerados pela Covid, como o Cloud Institute for Microbial Bioinformatics, iniciado em 2014 e rebatizado de Covid-19 Genomics UK Consortium (COG-UK). Ele foi fechado há um ano.

Por um tempo, diferentes instalações lidaram com os crescentes dados genômicos de forma diferente, complicando os esforços para se manter à frente do vírus em um cenário semelhante ao da Torre de Babel.

Em outra frente, a vigilância precisava atingir todas as partes do ambiente, de superfícies a aerossóis e suprimentos de água. Ainda estamos descobrindo exatamente como o vírus viaja do ar para o trato respiratório humano. Atualmente, o número de sequências do SARS-CoV-2 no GISAID está se aproximando de 17 milhões, à medida que o vírus se estabelece em sequências predominantes que permitem e até alimentam sua persistência. Essas dinâmicas virais exibem a própria essência da seleção natural, a força motriz mais poderosa por trás da evolução.

A página de abertura do GISAID hoje apresenta ícones de nações, cada uma com uma árvore evolutiva do vírus enfeitada com galhos exibindo suas variantes (veja Como Surgem as Variantes Virais). Esses dados estão alimentando a vigilância genômica global. Um comunicado de imprensa que acompanha o artigo da Frontiers in Science, “Genômica para evitar pandemias”, fornece perspectiva e comentários. O autor principal, Marc Struelens, da Université libre de Bruxelles, Bélgica, afirmou: “Doenças infecciosas propensas a epidemias cruzam fronteiras com a mesma rapidez com que pessoas e mercadorias viajam pelo mundo. Um surto local hoje pode se tornar a próxima crise pandêmica mundial amanhã.”

Comparando sequências genômicas, também podemos rastrear a origem e o aumento da resistência a antibióticos entre novas espécies bacterianas e decifrar os papéis de diferentes espécies nos padrões de transmissão. Essas informações podem subsidiar o desenvolvimento de vacinas, terapias e medidas de saúde pública, o que pode ajudar a prevenir o surgimento de epidemias. Três avanços tecnológicos estão impulsionando a vigilância genômica.

No artigo anteriormente citado da Frontiers in Science, os autores pedem um investimento massivo para garantir treinamento, experiência e capacidade laboratorial adequados entre as nações. Eles apontam que, durante a Covid, os países com acesso pré-existente a experiência e equipamentos de vigilância genômica tiveram uma vantagem na vigilância de doenças, facilitando testes, tomando medidas de saúde pública e tratando pacientes.

O artigo fornece uma estrutura para a implementação equitativa de sistemas de vigilância global interconectados em todos os níveis de renda. Em um editorial que acompanha o artigo, Marion Koopmans, do Centro Médico Erasmus em Roterdã, Holanda, escreveu: “O artigo é leitura obrigatória para qualquer pessoa interessada em vigilância genômica como parte da preparação para epidemias. As ferramentas e a ambição estão lá — o próximo passo é construir infraestruturas de vigilância equitativas e colaborativas para a saúde global do futuro.”

Da próxima vez, acredito que possamos estar prontos ou mais preparados global e localmente.

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Carmino Antônio de Souza, professor titular da Unicamp. Foi secretário de saúde do estado de São Paulo na década de 1990 (1993-1994) e da cidade de Campinas entre 2013 e 2020. Secretário-executivo da secretaria extraordinária de ciência, pesquisa e desenvolvimento em saúde do governo do estado de São Paulo em 2022, Presidente do Conselho de Curadores da Fundação Butantan, membro do Conselho Superior e vice-presidente da Fapesp, pesquisador responsável pelo CEPID CancerThera da Fapesp.

Publicado em horacampinas.com.br